Com o avanço das técnicas de citogenética molecular foi possível mapear algumas regiões do cromossomo Y humano, com o objetivo de identificar e localizar alguns loci gênicos, antes ignorados pela biologia molecular, por serem atribuídos a fatores ambientais. Abaixo estão relacionados alguns desses loci:
(errata: onde está escrito alto-confiança leia-se auto-confiança)
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